学生がメッセージをメールで受け取らない設定にしていると、メールは送られません。
以下の手順で設定を変更するよう指導してください。

1. 画面右上の自分の名前 > プレファレンス　をクリック
2. 「メッセージプレファレンス」をクリック
3. 「通知プリファレンス」のメールをOnに変更
   　

なお、メールがOn/Offのどちらであっても、新規メッセージが届くと、Moodleの画面右上に図のように赤で未読件数が表示されます。