コースメタリンクを設定しても、子コースが削除されるわけではありません。ただし、非表示の状態になっています。
もしダッシュボードの「マイコース」ブロックから子コースが見えなくなった場合は、コースが非表示になったことで、一覧の下の方に移動している可能性があります。非表示のコースは、コース名がグレーで表示され、下の方にまとめて表示されます。
参考:【教員・学生】ダッシュボードのマイコースにコースが見当たりません。
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